以下是第四轮福建中医药大学学科评估结果，也是截至到目前最新的学科排名，其中比较好的学科是中西医结合，被评为B。
1、福建中医药大学专业评级和学科评估结果排名
第四轮学科评估于2016年4月启动，按照“自愿申请、免费参评”原则，采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行。
评估结果按“分档”方式呈现，具体方法是按“学科整体水平得分”的位次百分位，将前70%的学科分9档公布：前2%（或前2名）为A+，2%～5%为A（不含2%，下同），5%～10%为A-，10%～20%为B+，20%～30%为B，30%～40%为B-，40%～50%为C+，50%～60%为C，60%～70%为C-。
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科代码 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 10393 | 福建中医药大学 | 1006 | 中西医结合 | B |
| 2 | 10393 | 福建中医药大学 | 1005 | 中医学 | B- |
| 3 | 10393 | 福建中医药大学 | 1008 | 中药学 | C- |
| 4 | 10393 | 福建中医药大学 | 1011 | 护理学 | C- |
