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| 序号 | 学校名称 | 评估结果 |
| 1 | 北京中医药大学 | A+ |
| 2 | 上海中医药大学 | A+ |
| 3 | 复旦大学 | A- |
| 4 | 南京中医药大学 | A- |
| 5 | 广州中医药大学 | A- |
| 6 | 天津中医药大学 | B+ |
| 7 | 大连医科大学 | B+ |
| 8 | 辽宁中医药大学 | B+ |
| 9 | 四川大学 | B+ |
| 10 | 南方医科大学 | B+ |
| 11 | 北京大学 | B |
| 12 | 黑龙江中医药大学 | B |
| 13 | 福建中医药大学 | B |
| 14 | 华中科技大学 | B |
| 15 | 成都中医药大学 | B |
| 16 | 海军军医大学（第二军医大学） | B |
| 17 | 天津医科大学 | B- |
| 18 | 河北医科大学 | B- |
| 19 | 浙江中医药大学 | B- |
| 20 | 湖南中医药大学 | B- |
| 21 | 空军军医大学（第四军医大学） | B- |
| 22 | 北京协和医学院 | C+ |
| 23 | 上海交通大学 | C+ |
| 24 | 中国药科大学 | C+ |
| 25 | 安徽中医药大学 | C+ |
| 26 | 山东中医药大学 | C+ |
| 27 | 暨南大学 | C+ |
| 28 | 首都医科大学 | C |
| 29 | 江西中医药大学 | C |
| 30 | 中山大学 | C |
| 31 | 新疆医科大学 | C |
| 32 | 河北中医学院 | C |
| 33 | 湖北中医药大学 | C- |
| 34 | 广西中医药大学 | C- |
| 35 | 西安交通大学 | C- |
| 36 | 陕西中医药大学 | C- |
| 37 | 扬州大学 | C- |
中西医结合基础专业，中西医结合的一级学科，复旦大学国家重点学科，北京中医药大学、河北医科大学国家重点学科，华中科技大学国家重点学科。中西医结合基础学科在中西医结合防治心脑血管疾病及抗器官纤维化的原理研究、方剂生物效应的现代理论基础研究中医脉象现代生物学基础研究、针刺镇痛机理研究等方面形成了学科研究的特色。脑病病因病机、心脑损伤与器官纤维化的中医治法、脉诊与舌象现代生物学基础、针刺镇痛机理、方证关联理论的现代研究等已深入到细胞、基因水平，且取得了比较突出的成就。
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