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| 序号 | 学校名称 | 评估结果 |
| 1 | 北京协和医学院 | A+ |
| 2 | 中国药科大学 | A+ |
| 3 | 北京大学 | A |
| 4 | 沈阳药科大学 | A |
| 5 | 浙江大学 | A |
| 6 | 复旦大学 | A- |
| 7 | 上海交通大学 | A- |
| 8 | 山东大学 | A- |
| 9 | 中山大学 | A- |
| 10 | 四川大学 | A- |
| 11 | 海军军医大学（第二军医大学） | A- |
| 12 | 首都医科大学 | B+ |
| 13 | 哈尔滨医科大学 | B+ |
| 14 | 华东理工大学 | B+ |
| 15 | 苏州大学 | B+ |
| 16 | 中国海洋大学 | B+ |
| 17 | 武汉大学 | B+ |
| 18 | 华中科技大学 | B+ |
| 19 | 中南大学 | B+ |
| 20 | 空军军医大学（第四军医大学） | B+ |
| 21 | 南开大学 | B |
| 22 | 天津医科大学 | B |
| 23 | 中国医科大学 | B |
| 24 | 吉林大学 | B |
| 25 | 南京医科大学 | B |
| 26 | 浙江工业大学 | B |
| 27 | 安徽医科大学 | B |
| 28 | 郑州大学 | B |
| 29 | 广东药科大学 | B |
| 30 | 西安交通大学 | B |
| 31 | 南方医科大学 | B |
| 32 | 河北医科大学 | B- |
| 33 | 辽宁中医药大学 | B- |
| 34 | 延边大学 | B- |
| 35 | 黑龙江中医药大学 | B- |
| 36 | 南京中医药大学 | B- |
| 37 | 温州医科大学 | B- |
| 38 | 厦门大学 | B- |
| 39 | 暨南大学 | B- |
| 40 | 重庆医科大学 | B- |
| 41 | 新疆医科大学 | B- |
| 42 | 天津中医药大学 | C+ |
| 43 | 大连医科大学 | C+ |
| 44 | 南京工业大学 | C+ |
| 45 | 江南大学 | C+ |
| 46 | 江苏大学 | C+ |
| 47 | 徐州医科大学 | C+ |
| 48 | 浙江中医药大学 | C+ |
| 49 | 湖南中医药大学 | C+ |
| 50 | 广西医科大学 | C+ |
| 51 | 贵州医科大学 | C+ |
| 52 | 兰州大学 | C+ |
| 53 | 天津科技大学 | C |
| 54 | 山西医科大学 | C |
| 55 | 南昌大学 | C |
| 56 | 山东中医药大学 | C |
| 57 | 汕头大学 | C |
| 58 | 广州医科大学 | C |
| 59 | 成都中医药大学 | C |
| 60 | 遵义医学院 | C |
| 61 | 昆明医科大学 | C |
| 62 | 烟台大学 | C |
| 63 | 北京化工大学 | C- |
| 64 | 同济大学 | C- |
| 65 | 安徽中医药大学 | C- |
| 66 | 济南大学 | C- |
| 67 | 新乡医学院 | C- |
| 68 | 湖北中医药大学 | C- |
| 69 | 广州中医药大学 | C- |
| 70 | 西南交通大学 | C- |
| 71 | 青岛大学 | C- |
| 72 | 成都大学 | C- |
药物化学专业是一级学科药学下设的二级学科，本专业是培养能在科研与开发生产领域从事药物合成，药物设计和功能基因药物的研究，药品监督和管理的高级专业人才。本专业的毕业生具有在高校，科研机构及企业从事教学，科研及新产品，新设备，新工艺的开发研究等专门技术工作的能力。掌握现代化学合成药物和天然药物提取，合成新工艺和手性技术的研究方法，能独立地，创造性地开展新药研究与开发，具有分析问题，解决复杂疑难问题的能力。
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