一、考试试题不同
| 种类 | 政治（统考） | 英语（统考） | 业务课一 | 业务课二（统考） |
| 金融硕士 | 思想政治理论 | 英语一或英语二 | 数学三（统考）或396经济类联考综合 | 金融学综合 |
| 金融学硕士 | 思想政治理论 | 英语一 | 数学三（统考） | 经济学 |
注意：目前专硕考试的趋势是统一考英语二和经济学联考综合：英语二较英语一考察的英语词汇量更少、分析能力要求更低、难度相对小;经济类联考综合考察数学知识简单，基本为初高中内容，添加逻辑能力的考察，整体难度小于数三。
二、培养方式不同
| 种类 | 学制类型 | 学制 | 培养方式 |
| 金融硕士 | 应用型硕士 | 2年 | 自费 |
| 金融学硕士 | 学术型硕士 | 一般3年 | 公费或自费或委培 |
三、课程设置不同
在课程设置上金融学硕士作为学历教育，重点是基础教育、素质教育和专业教育，偏重理论知识的掌握和学习;金融硕士作为职业教育，则更多偏重于实务，学习的目的是为了解决实际工作中的问题。例如，金融学硕士第-年会着重学习高级微观、高级宏观、中级金融理论、金融思想史;金融硕士则不要求，更侧重于金融工具、计量经济学、统计学、证券投资的学习。
四、导师制度不同
按照教育部指导规划，专业硕士采取双导师制度，即社会导师和校内导师双导师。
五、读博要求不同
专业硕士不能直博，即不能直接保送读博，但仍可以考博;学术型硕士目前改革试点院校提供较少比例的直博名额，入学筛选后确定。
六、金融专硕代表未来方向
随着硕士招生的改革不断推进，专硕已经开始与学硕并驾齐驱，后者注重研究型人才培养，前者注重应用培养，各有所长;从中央财经、人大10级会计专硕的就业趋势来看，完全不逊于学硕。金融专业本身就具有实践性强的特点，两年的全日制专业硕士(学硕一般三年)的培养方式更能满足就业的需要。长期以来社会上一直存在大学教育与社会实践脱节的批评，专业硕士的出台有利于改善这种状况。
