2018年辽宁大学研究生考试851生物信息学考试大纲公布如下
全国硕士研究生招生考试自命题科目考试大纲
考试科目: 生物信息学
一、考试形式和试卷结构
(一)试卷满分及考试时间
本试卷满分为 150 分,考试时间为 180 分钟。
(二)试卷题型结构及分值比例
名词解释(约30分);简答题(约40分);问答题(约50分);论述题(约30分)。
二、考查内容
1.生物信息学相关概念、主要研究方向、相关发展简史、相关重要事件及发展趋势。
2.生物信息学中常用生物数据(核酸序列数据、蛋白质序列数据、蛋白质结构数据)的测定方法,常用的数据库序列数据存储格式。
3.重要的生物信息学网站,重要数据库的使用方法,主要包括核酸数据库、基因组数据库、蛋白质数据库及蛋白质结构数据库。生物信息学数据库的相关概念。
4.遗传密码与蛋白合成概念、方法,开放阅读框的预测方法,真核生物基因预测与外显子识别关系的方法,基因序列的注释方法。
5.序列比对的概念,掌握一致性、相似性、同源性的概念及其之间的区别,常用的序列比对算法和软件,常见打分矩阵和空位罚分体系。
6.序列数据库搜索工具BLAST,各种BLAST结果的含义, BLAST算法的原理及NCBI BLAST各参数的含义。
7.系统发育进化树相关概念,使用MEGA等软件构建进化树的方法,三种常见的进化树构建算法(近邻法、最大简约法、最大似然法)的概念、原理、方法。
8.蛋白质结构的组成和层次,序列相似性与结构相似性同蛋白质分类之间的关系,蛋白质结构分类及相关数据库。蛋白质三维结构的可视化的概念和方法。
9.蛋白质家族、蛋白质信号及其表示方式,主要包括一致序列、序列模式、多序列联配无空位片段、序列谱以及相关数据库,主要包括Prosite、PRINTS、Pfam等数据库。
10.蛋白质序列分析与功能的预测方法,主要包括理化性质、跨膜螺旋、信号肽、翻译后修饰、亚细胞定位等。蛋白质结构预测常用方法,包括二级结构和三级结构。
11.基因和蛋白质芯片的概念、原理及其主要应用。
12.数据挖掘与机器学习的概念,常见机器学习算法。
13.基于结构的药物设计的概念、方法。