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一般认为光敏色素与膜系统结合，分布在质膜、线粒体膜、核膜、叶绿体膜和内质网膜上，Pr型的吸收高峰在660nm，Pfr型的吸收高峰在730nm。二类型光敏色素在不同光谱作用下可互相转换，当Pr型吸收660nm红光后就转变为Pfr，而Pfr吸收730nm远红光后会转为Pf型。
植物组织中，不论是黄色或绿色组织中都至少存在两种类型的光敏色素分子：光敏色素Ⅰ(PⅠ)和光敏色素Ⅱ(PⅡ)。前者为光不稳定型、后者为光稳定型。PⅠ在黄化组织中大量存在，在光转变为Pfr后就迅速降解，因此在绿色组织中含量较低。PⅡ在黄化组织中含量较低，仅为PⅠ的1～2‰，但光转变为Pfr后较稳定，加之在绿色植物中PⅠ被选择性降解，因而PⅡ虽然含量低，却是绿色植物中主要的光敏色素。两类光敏色素分别调控不同的生理反应。一般认为PⅠ参与调控的反应时间较短，而PⅡ参与调控的反应时间较长。PⅡ调控的反应有时不被远红光和暗期所逆转。
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