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mRNA上每3个相邻的核苷酸编成一个密码子，代表某种氨基酸或肽链合成的起始或终止信(4种核苷酸共组成64个密码子)。
其特点有：①方向性：编码方向是5′→3′;
②无标点性：密码子连续排列，既无间隔又无重叠;③简并性：除了Met和Trp各只有一个密码子之外，其余每种氨基酸都有2~6个密码子;
④通用性：不同生物共用一套密码;仅仅在动物线粒体和少数原核生物中个别密码子有差异;
⑤摆动性：在密码子与反密码子相互识别的过程中密码子的第一个核苷酸起决定性作用，而第二个、尤其是第三个核苷酸能够在一定范围内进行变动。
