我校生物医学工程专业是全国第一批建立的学科点(1979年建立)，也是我校所拥有的19个全国重点一级学科之一。30年来的发展，我们的学术声誉和学生培养质量得到了国内乃至国际同行的广泛认可，在2012年的重点学科评估中获得了全国第二。
在研究生教育上生物医学工程系历来都给予充分的重视。生医建设的两门研究生课程获得清华大学精品课程称号，《数字信号处理》、《医学成像系统》《随机信号统计处理》等教科书都成为了研究生推荐教材，在很多高校采用；
本系2009年入选全国博士学位论文提名论文1篇，2010年获得清华大学博士学位论文一等奖。2010年数字信号处理再次获得清华大学精品课称号，2011年随机信号统计处理也再次获得清华大学精品课称号。我们的毕业生在生物医学工程的学术研究、药监管理、创新产品开发和产业发展方面都在发挥很重要的作用。
生物医学工程研究方向是运用现代工程技术与生物医学原理相结合、基础与临床相结合的新技术、新方法,提供工程技术手段解决临床实际问题的方法和思路。我校生物医学工程学科历来注重对学生基础知识、实践能力、创新能力和综合素质的锻炼，将致力于培养推动本学科发展的学术骨干，以及推动相关产业进步的杰出领军人才作为我们培养和学科发展的双重任务。
生物医学工程专业可以招收攻读工学博士学位、工学硕士学位和工程硕士学位的研究生。欢迎有交叉背景的学生报考清华大学生物医学工程专业。
