复旦MBA项目（非全日制）、国际MBA和S3亚洲MBA项目有以下区别：
（1）报考要求不同：
复旦MBA项目（非全日制）：算至入学时，大专毕业后有五年及五年以上工作经验者；本科毕业后有三年及三年以上工作经验者；已获硕士学位或博士学位并有二年及二年以上工作经验者：
国际MBA/ S3亚洲MBA项目：算至入学时，本科毕业后有三年及三年以上工作经验者（有学士学位）或已获硕士学位或博士学位并有二年及二年以上工作经验者。
（2）授予学位不同：
复旦MBA项目（非全日制）：复旦大学硕士研究生毕业证书和工商管理硕士学位证；（双证）
国际MBA项目：复旦大学硕士研究生毕业证书和工商管理硕士学位证及麻省理工学院斯隆管理学院（MIT Sloan）学习证明书；（复旦双证＋MIT学习证明书）
S3亚洲MBA项目：复旦大学研究生毕业证书和工商管理硕士学位证书，同时可以申请韩国高丽大学或新加坡国立大学工商管理硕士学位证书，以及三所大学联合颁发的S3亚洲MBA项目学习证书。（复旦双证＋第二个学位证）
（3）项目学制和招生人数不同：
复旦MBA项目（非全日制）：在职学习，每周1个工作日的晚上及双休日的一天上课，中文授课为主，学制二年半，2020年计划招生700人；
国际MBA项目：全脱产学习，周一至周五上课，全英文授课，学制二年，2020年计划招生100人；
S3亚洲MBA项目：全脱产学习，周一至周五上课，全英文授课，学生将分别在复旦大学、高丽大学和新加坡国立大学完成一个学期的学习，学制二年，2020年计划招生20人。
注：中央及地方党校学历不予承认。
